Юлий Михайлович Шокальский награждён орденами Святого Станислава 1-й степени, Святого Владимира 3-й и 4-й степеней, бельгийским Кавалерским крестом, французским орденом Почётного легиона. Удостоен высокого звания Герой Труда.
Шокальский проявлял глубокий интерес к полярным исследованиям, изучению Северного морского пути и Арктики. Его именем названы два острова в проливе Карские Ворота и остров при входе в Обскую губу; подводный хребет у острова Уруп и горный хребет на этом же острове Курильской гряды; пролив в Северном Ледовитом океане, отделяющий остров Октябрьской Революции от острова Большевик (архипелаг Северная Земля); озеро на полуострове Канин; ледник на Северном острове Новой Земли, названный так
Георгием Яковлевичем Седовым; долинный ледник в Казахстане, ледники на пике Гармо (Таджикистан) и на Алтае; пик и ледник в Богдо-Ола (Восточный Тянь-Шань); тёплое течение в Баренцевом море, идущее вокруг Шпицбергена; бухта на северо-восточном побережье Земли Александра I в Антарктиде. [2]